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稻屬最全超級泛基因組圖譜問世

王洋 李玉蘭 胡曉軍
2024年11月21日07:41 | 來源:光明日報
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日前,國際學術期刊《自然·通訊》在線刊發江西省農業科學院原院長顏龍安院士團隊聯合河北大學杜會龍教授團隊的研究成果:首個稻屬最全超級泛基因組圖譜繪制成功。

泛基因組是一個物種中所有個體基因組信息的總和,構建泛基因組可以有效解決單一參考基因組帶來的遺傳信息分析偏差。超級泛基因組代表一個屬內所有物種的基因組信息,尤其蘊含了野生種中豐富的基因組變異,是對泛基因組的進一步擴展,在遠緣雜交和基因發掘等方向具有重要應用前景。稻屬隸屬於禾本科的稻亞科,包括2個栽培稻種和21個野生稻種。其中,野生稻為栽培稻近緣物種,是現代水稻品種遺傳改良和種質創新的基因寶庫,具有重要的挖掘價值。

研究團隊組裝了稻屬13個近乎完美的野生稻種的基因組,並結合已公開的普通野生稻、亞洲栽培稻和非洲栽培稻基因組,構建了包含101723個基因家族的稻屬超級泛基因組。其中,稻屬共有的核心基因家族僅佔9.84%,共鑒定到63881個栽培稻中尚未發現的新基因家族,使可利用的水稻基因擴大了1.7倍。同時,基於高質量的基因組圖譜,首次在基因組水平重構了稻屬的進化關系。

該研究構建的稻屬超級泛基因組極大地擴展了水稻遺傳改良的基因池,對野生稻種質創新利用具有重要理論意義和應用價值,同時為稻屬進化和馴化研究提供新的見解。

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(責編:李慧博、吳昊)

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