我國學者開發構建了精神分裂症的遺傳數據庫SZDB

2017年03月24日09:11  來源:科技日報
 
原標題:我學者構建精神分裂症遺傳研究數據庫

近日,中國科學院昆明動物研究所羅雄劍課題組和姚永剛課題組開展合作,開發構建了精神分裂症的遺傳數據庫SZDB。

關於精神分裂症的研究有兩個重要問題仍有待解決:第一,大量遺傳學研究已鑒別出許多與精神分裂症顯著相關的遺傳變異,而這些遺傳變異如何導致疾病易感目前仍不清楚。第二,除遺傳研究外,人們還開展了大量其他方面的研究,並積累了眾多相關數據,如差異基因表達數據、表觀遺傳數據、基因共表達數據等,如何從積累的這些海量數據中抽提出有意義的生物學信息仍然是一個挑戰。

為了給上述問題提供一個可能的解決方案,同時也為研究者提供一個易於使用和查詢的數據資源平台,羅雄劍課題組和姚永剛課題組合作開發構建了精神分裂症的遺傳數據庫SZDB。SZDB收集了眾多與精神分裂症相關的數據,包括遺傳研究數據(如來自於遺傳連鎖和關聯研究、GWAS、外顯子組測序、拷貝數變異、整合分析等的數據)、基因表達數據(包含差異表達和時空表達模式的數據)、網絡數據(蛋白相互作用和共表達網絡)、大腦eQTL數據以及SNP功能注釋數據等。通過對這些不同層面的數據進行整合和分析,鑒別一些重要的精神分裂症候選基因。 (記者 馬波)

(責編:張萌、張希)